Alt+F4でアプリケーションが終了しないようにしたい

＞Windows として、方法はないでしょう。

＞そういったサードパーティーのホットキーソフトで握りつぶせないなら、どうしようもありません。

過去のWindowsでは、恐らくこのような場合に対応するためにだろうと思いますが、レジストリにスイッチが用意されていたのですが、やはりWindows10は方法がないのですね。（おっしゃる通り、管理者権限での実行が必要なアプリケーションです。管理者権限で実行されているアプリケーションはホットキーに介入できないのですね。）

＞Windows の フィードバック Hub に要望を登録することは自由ですが、採用される可能性は低いし、採用されるまでに期間が空くので、アプリケーション側の改善を要望した方が良いのでは？

確かに、アプリケーション側で、Ｆ1～F9、または、ALTキーのどちらかを使用しないよう設計しなおしてもらえれば、頻繁にキー入力するうち、ALTキーとF4キーが同時に押下げられる可能性はほぼなくなると思いますが、ファンクションキー、ALTキー共に、それぞれ意味をもたせ、それぞれに特有のコマンドを実行するために１５年以上にわたって使用されているため、今からそのコマンド体系自体を変更して設計しなおしてくれというわけにはいかなさそうです。

＞Alt+F4 は Windows のデフォルト処理として実装されていることが大半ですが、アプリケーション側でそういうコードを重複して実装することができます。

このアプリケーションの場合は、ALT+F4での終了操作を敢えて「させたい」と考え作成されている可能性はほぼない（制作側も誤動作での終了を望んではいない）と思いますので、アプリケーション側での実装はないと思いますが、確かに、そのような場合もあり得ますね。

いろいろな場合を想定したご説明、大変参考になりました。回避方法がないのは残念ですが、状況がよく分かりました。

追記：

その後、Azulean様のコメントの、

＞そのアプリケーションだけ効果がないのであれば、「そのアプリケーションを管理者権限で実行している」か、

をヒントに、アプリケーション側が権利者権限で実行されることが原因で、PowerToysが機能しないのであれば、PowerToys側も管理者権限で実行すれば、ホットキーのリマップが有効になる可能性があると考え、試してみたところ、対象のアプリケーションにおいて、ALt+F4のリマップが実現できました。ゲームの動作などで他にお困りの方もおられるようですので、一つの解決方法として追記しておきます。

Windowsのタスク管理の基本操作の一つであり、むしろAlt+F4キーでアプリケーションが終了しない方が問題になります。

それぞれに特有のコマンドを実行するために１５年以上にわたって使用されているため、今からそのコマンド体系自体を変更して設計しなおしてくれというわけにはいかなさそうです。

蛇足ですが、15 年以上で比較するなら、Windows の Alt+F4 の歴史の方が古いです。

30 年以上前からその組み合わせなので…。

逆に言えば、15 年以上もそのまま据え置かれているということは、こういった苦情がなかったか、苦情・要望を放置するか、メンテナンスされていないかなのでしょうね。

そのアプリケーションにキーカスタマイズ機能があるのであれば、それで対応を考えるところでしょう。

このアプリケーションの場合は、ALT+F4での終了操作を敢えて「させたい」と考え作成されている可能性はほぼない（制作側も誤動作での終了を望んではいない）と思いますので、アプリケーション側での実装はないと思いますが、確かに、そのような場合もあり得ますね。

それは作者のみぞ知ることなので、推測は困難でしょう。

誤動作での終了を望んでいないなら、Alt や F4 にコマンドを割り当てないでしょうから、その説は考えづらいと私は思いました。