mizuuchi さん、こんにちは。
手元の Vista Home Premium SP2、Vista Ultimate SP2 で確認してみたのですが、どちらも「pending.xml」がありませんでした。
実際そのファイルがあるかどうかも問題になるのかもしれません。
US の Answers に、「pending.xml」のリネームについての投稿がありましたので、こちらを参考にしてみました。
takeown コマンドや、caclsコマンド など、アクセス権、所有権の設定が必要な感じですね。
Updates not configurated correctly. Reverting changes.
http://social.answers.microsoft.com/Forums/en-SG/vistawu/thread/2f5299ab-024c-4a78-a602-56b4e98cc589
システム回復オプションからのコマンドプロンプトでは、takeown や cacls コマンドの実行ができなかったので、ちょっと難しいのかもしれません。
ただ、参考になるかもしれませんので、確認してみてください。
鈴木裕子 – Microsoft Support