対応ありがとうございます。
投稿内容を参考に確認したところ、原因(というかトリガー)が特定できましたので、報告させて頂きます。
まず、マウス(Logicool VX-N、ドライバ:SetPoint4.82)でボタンにキー割り当てを行っています。
割り当て内容としては、chromeを使用中には、あるボタンに「ctrl+w」を割り当てています。
そして、chromeのタブをひとつのウインドウで複数開いたとして、マウスボタンを押し続け、そのまま最後のウインドウをマウスボタン(ctlr+w割り当て)で閉じると、ctrlキーがロックされるようです。
原因は、マウスドライバに関連していそうなのですが、最新のドライバは、細かい設定が出来なくなっていたので、敬遠しています・・・
対策としては、ドライバを変更するしかないでしょうかね・・・
なお、セーフモード、クリーンブートは検証に時間がかかりそうなので作業できていません・・・