その後の状況をご報告いたします。
常駐ソフトは元から少なかったのですが、余計なものは極力外してみました。
それからアドバイスに従いロジクールのセットポイントをアンインストールしてみましたが、残念ながら症状は改善しませんでした。
そこで、マウス内部のほこりを綺麗に掃除した後にチャタリング対策用のソフトウェアを試したところ、大幅に症状が改善しました。
そんな訳でセーフモードでは試していませんが、今回はタイミング悪くマウスの物理的な寿命がきた可能性が高いと思います。
ちなみに使用したソフトウェアは、ChatteringCancelerです。
ご参考までに。