今野さん、回答ありがとうございます。
しかし、私がタスクスケジュールで実行しているのはWSHです。
結果的に解決しましたが・・・・
下記の様な簡単なやつなのですが
Set WshShell=Wscript.CreateObject("Wscript.Shell")
WshShell.Run("d:\TEST\test.exe")
WScript.Sleep(5000)
WshShell.SendKeys("{DOWN 2}")
WshShell.SendKeys("%R")
WshShell.SendKeys("{ENTER}")
"test.exe"というツールがあり、起動すると画面が表示されます。
デフォルトのカーソル位置から2個下がったところにフォーカスを当ててツールを実行するのですが
DOS窓が最前面に表示されてしまいtest.exeにフォーカスを当てられないのです。
質問をした後で気付いたのですが実行にオプションを付けました。
WshShell.Run("d:\TEST\test.exe", 3, True)
これで解決しました、ありがとうございました。