Gazania さん、こんにちは。
マイクロソフト コミュニティへの投稿ありがとうございます。
システム イメージの作成で E: ドライブが含まれて、ファイルの移動をしても対象から除外されないのですね。
似たような内容で、過去に以下のようなスレッドがありました。
・\[Win7\] システムイメージの作成で、外付けUSBドライブもシステムドライブと認識される
・Windows7のバックアップと復元でのシステムイメージの作成でFドライブが追加される
上記のスレッドで紹介されている「ドライブ文字の変更」の操作を試してみてはいかがでしょう。
操作手順で分からない点などがあれば、追加で書いてみてくださいね。
確認された結果など、ご返信をお待ちしています。