Windowsのパソコンが通話状態になったのだからAppleに相談すべき内容とは言い切れないでしょう。 というか半分はWindowsの話なんだからここでも話してよいでしょう?
ただこれは重大な問題の可能性もあるので、Appleにも相談することをお勧めします。
まずお尋ねしたいのはそのパソコンとスマホはbluetoothでペアリングされていますか?
されていなかった場合ですが、おもしろくなってくる可能性があります。
Windows10はほとんどすべてのユーザー情報をスパイしています(言葉は悪いですがアメリカでspyingと呼ばれているので他に適切な訳語がありませんから。あったら教えてください)。
あなたが入力するすべての文字や、検索ワード、どのアプリを何時から何時まで起動しているかなどです。マイクを使ったり、位置情報などあらゆるデータをスパイしています。これらはユーザーが同意しているので法的には問題ありません。倫理的には問題が言われています。
それでもさすがにWifiの別端末間のパケットを盗聴しているかもしれない、という話は初めて聞きました。非常に興味深いです。
なぜならスマホとWifiのアクセスポイント間の通信を盗むにしても普通の方法ではできません。ミラーモードに切り替えるなどハッキング技術のようなものが必要になってきます。
もし質問者さんの言っていることが本当であれば、Amazon Echoが普段からの会話をすべて録音してどこかに送っているのをバグで知人宅のスピーカーに送って大問題になりましたが、それに匹敵する大問題になるかもしれない事象のように思います。
なので以下、差し支えない範囲で情報を補足していただけませんか?
Facetimeを使っていたスマホ端末名とそのバージョン
会話が聞こえたパソコンの機種とWindowsのバージョン
スマホはwifi接続だと思いますが、パソコンも同じアクセスポイントに接続していますか?
Wifiアクセスポイントで使用している暗号化形式はなんですか?
Windows側にAppleのソフトウェアは何かインストールされていますか?