質問内容がよく分かりません。
通常は自動更新にしているのでしょうか。
<クリーンインストール> パソコンをリカバリーしたのですか?
それともクリーンブートのことでしょうか。
<トラブルシューティングツール使用> 具体的にどのツールを使ったのでしょうか。
また、<Windows Updateを手動で行う> という方法の具体的な手順が分かりません。
【KB4474419】と【KB4490628(一連の更新を行わないと更新対象にはならないかもしれません)】は、今後のWindows Updateを問題なく行うために必要な更新になります。
過去の更新や3月の月例ロールアップ更新【KB4489878】は問題なく更新できているのでしょうか。
既に実行済かもしれませんが、一般的な対処法として次のことを試してみてください。
下のサイトを参考にして、Windows Updateの設定を「更新プログラムを確認しない(推奨されません)」に変更してPCを再起動する(作業後は元に戻してください)。
Microsoft Updateカタログから適合する更新ファイルをダウンロードして保存して、保存したファイルを使って更新する。
更新できない場合はクリーンブートで更新する。
Windows Updateのトラブルシューティングツールもいくつかあります。
Windows Updateのトラブルに対する一般的な対処法をまとめて、下のスレッドの2つ目の返信**【③****Windows Update** **不具合の一般的な対処法】**に投稿していますので参考にしてください。
なお、下のスレッドにある【KB3177467】は【KB4490628】で置き換えられるものですから、場合によっては適用できないかもしれません。