ruumeruho さん、こんにちは。
マイクロソフト コミュニティをご利用いただき、ありがとうございます。
SD カードに保存した暗号化したデータについてのご質問ですね。
暗号化したデータは通常よりも解けにくいものですが、絶対に解除できないというものではないので、流出する可能性はないとは言えないと思います。。
パスワード変更や二段階認証の有効化、PC の初期化などすでに行われたのは良い対処だと思います。
SD カードに保存していたデータについては、マイクロソフト関連以外のものもあれば、変更できそうなものは変更しておくとさらに安心かもしれませんね。
なお、下記ページではセキュリティ対策や PC を安全に使うポイントがまとめられているので、よろしければこちらも今後の参考にしていただければと思います。
他にも何かアドバイスがある方がいらっしゃれば、ruumeruho さんへのコメントお待ちしています。