SowMX さん、こんにちは。
マイクロソフト コミュニティへの投稿ありがとうございます。
日本語キーボードと US キーボード共存の設定が、Windows Update 後に反映されなくなってしまったのですね。
・Windows 10 および Windows Server の更新履歴
上記ページの 2 月の更新や海外フォーラムなども含め、関連するような報告がないか調べてみましたが、こちらでは情報を見つけることはできなかったです。。。
こちらの件について何か情報をお持ちの方がいらっしゃいましたら、書き込みをお待ちしています。