ファイルシステムのチェックとシステムの修復はやっておきましょう。特定の拡張子のファイルを操作したときに発生するのであれば、その拡張子の[既定のアプリ]についても、再インストールをしておいた方がいいです。
ファイルsの修復については、chkdskコマンドでファイルシステムの修復をした後、Windows Updateのトラブルシューティングを参考にDismコマンドやSfcコマンドでシステムの修復を行うことになります。
参考:Windows 製品の更新プログラム (KB) のインストールの失敗 … 一般的な対処策
https://blogs.technet.microsoft.com/askcorejp/2...
それでも解消できない場合には、保存しておきたいデータを別のメディアにバックアップしてから、Windowsのインストールメディアでパソコンを起動して、カスタムインストールで既存のパーティションを削除して、新規にWindowsをインストールすることになります。Windowsの上書きインストールで修復できる場合もありますが、システムの壊れ方によっては、起動できなくなることもありますので、次善の策になります。