こやま さん、こんにちは。
マイクロソフト コミュニティへの投稿ありがとうございます。
SyncToy 2.1 でコマンドラインからの操作を行うとエラーが出るのですね。
SyncToy 2.1 のシステム要件は Windows 7 までとなっており、Windows 10 での動作について説明された資料などを見つけることはできなかったです。(こちらの手元でも環境を用意できず、実際の動作を確認してみることはできませんでした)
こちらのツールについての話題は、一般ユーザー向けのマイクロソフト コミュニティよりも管理者向けの「TechNet フォーラム」に投稿をされた方がアドバイスが集まりやすいかと思いますので、よければそちらをご活用されてみてはいかがでしょう。