2台のパソコンのMSアカウントを同じにすべきか、違うMSアカウントを設定すべきかということでしょうか?
同じMSアカウントにした場合は、起動時のパスワードが同じになり別々にすることは不可。
起動時に表示される名前が2台のパソコンで同じになる。
OneDriveのアカウントが共通になるので、使っていたらファイルが同期される。
Skypeは多分関係ない。
壁紙やお気に入りが同期される(同期のオンオフ可能)
MSアカウントでメールの送受信してたら2台のパソコンに同じメールが届く。
くらいでしょうか。
同期させたい場合は同じアカウントで、同期させたくない場合は別々のアカウントを設定するのがいいでしょう。