こんにちは。
Excel ファイルの共有をするとファイルが破損するとのことですが、
他のファイルでも同じようなので Server 側に問題がある可能性があります。
使用されている Windows Server のバージョンが不明ですが、セキュリティソフトの完全削除やクリーンブートなどは確認されているでしょうか。
なお、ここは一般向けのコミュニティなので、サーバー製品など管理者向けの内容であれば下記の technet のフォーラムの方が適切な情報が得られると思います。
https://social.technet.microsoft.com/Forums/ja-...
もしくは、マイクロソフトからの公式サポートが必要であれば、
下記のようなサービスを利用された方が良いと思います。