Dドライブにデスクトップやドキュメント等を移動しているので
M2 はSATA とは異なり、個別の対応するデバイスドライバーを必要とする PCIe ボードなので、これが原因だと推測します。つまりM2デバイスでは、BIOSで認識しても Windows にはドライバーが無くて認識しない場合や、逆に Windows で認識しても、BIOSで認識しない場合があります。BIOSとWindowsとで、別の2種類の対応するドライバーを必要とするからです。
解決策はないでしょうか
ということで、Dドライブへ移動したものをすべて元に戻してみるか、実際に使用するハードウェア構成を確定させた上で、その環境に Windows 11を新規インストールし直してはいかがでしょうか?