こんにちは。
海外ユーザーの報告では、Microsoft Flight Simulatorのアップデートで大幅なフレームレートの低下の不具合が発生したユーザーがいるようです。
アップデートによる何かしらの不具合があるのかもしれません。
個別のゲームには専用のコミュニティーやサポート窓口があります。
VR用のコントローラー設定を行う前の、システムの復元ポイントにてシステムの復元を試してみてください。
「システムの復元を使用する」
https://support.microsoft.com/ja-jp/windows/%E3...
それでも反応しない場合は、以下からリクエストを送信してください。
「Microsoft Flight Simulator リクエストの送信」