メモリーが故障することは稀なので、無効にしても問題が起きることは少ないと思います。
メモリー診断は手動で行うこともできますので、何か不具合がありメモリーに原因がある可能性があれば手動で診断すればいいのかもしれません。
なお、[RunFullMemoryDiagnostic]を無効にした場合は自動メンテナンスで行われるメモリー診断も行われなくなると思いますし、下のサイトの設定にある「メンテナンスの開始」をクリックしてもメモリー診断は実行されません。
MemoryDiagnostic\ProcessMemoryDiagnosticEvents
MemoryDiagnostic\RunFullMemoryDiagnostic
アイドル状態(CPU使用率が数%)で[RunFullMemoryDiagnostic]を右クリックメニューから実行してみると、CPU使用率は20~40%に上昇しますが、ファンが高回転してうるさくなるということはありませんでした。
PCによって異なるので質問にある症状が異常かどうかは分かりませんが、CPU使用率が20~30%でファンが高回転するとすれば別の問題があるかもしれません。
また、アイドル状態でもCPU使用率が高いとすれば、不要なアプリをアンインストールするとかスタートアップを無効にするという方法もあります。
メモリー診断を無効にする前に、下のサイトのようなことも確認してみたらどうでしょうか。
なお、このサイトは1投稿で質問内容は1つにするというルールがありますので、これらについて疑問がある場合は別の質問として新規投稿した方がいいと思います。