結果の報告です。
>1) ワーキングスレッドの増加によるリソース管理処理の改善
>レジストリの以下の項目を変えてみる
こちらの設定を試したところ、事象が改善したように見えています。
週明けにリモート接続するとほぼ100%で事象発生していましたが、今日は5秒停止するようなウインドウは一つもありませんでした。
>そのフリーズしている5秒間に対応するログが、イベントログに記録されていませんか?
なお、先にログを確認しましたが、事象発生タイミングで特に気になるログはありませんでした(見つけられませんでした)。
もう少し様子を見てみますが、今までの発生状況から考えると確実に改善しています。
この事象には非常に悩まされており、改善して本当にうれしいです。
Takashi NISHIIEさん、アドバイスいただきありがとうございました。