フォルダーごと(複数ファイルを同時に)移動するあるいは削除しようとして操作できないファイルがあると表示されますが、チェックを入れないと同種ファイルがある度に1つずつ「スキップ」を選択していくことになり、チェックすれば移動できるものは移動して移動できないものは「スキップ」操作を行わなくてもスキップされます。
チェックを入れても入れなくても結果は変わりません。
チェックすれば「スキップ」操作を行う手間がかからなくなるだけです。
なお、移動できない場合は「コピー」ならできる場合がありますが、コピーできても元ファイルが削除できないかもしれません。
<ファイル 移動できない>とか<ファイル 削除できない>などのキーワードでネット検索すれば多くの情報(対処法)が見つかると思います。
このサイトは1投稿で質問内容は1つというルールがあるので、移動や削除できない問題について解決しない場合は別の質問として投稿してみたらどうでしょうか。