Web、メール、印刷ドキュメントを作成するための Microsoft ワード プロセッシング ソフトウェア製品のファミリ。
スペルチェックや変更履歴機能は問題なく、文書比較だけで問題が発生するのでしょうか?
Windows Vista SP2+Office 2010 Professional Plusで文書の比較を行ってみましたが、問題ありませんでした。
問題が解消できるか分かりませんが、下記のトラブルシューティングを行ってみてはどうでしょうか。
Word 2010、Word 2007、Word 2003、または Word 2002 の起動時または使用時に発生する問題のトラブルシューティング方法
Susumu Zenba
Microsoft MVP for Business Productivity-Word