Web、メール、印刷ドキュメントを作成するための Microsoft ワード プロセッシング ソフトウェア製品のファミリ。
開いた文書の内容の変更が何も無しで、表示倍率だけを変更して上書き保存を行っても、元ファイルには上書き保存がされないためかと思います。
開いたファイルの表示倍率を変えて内容を一部変更し上書き保存し、再度開いて倍率を確認し、変更箇所を削除して再度上書き保存で、
元ファイルの表示倍率は100%に変わると思います。
表示倍率を100%に変更したものを名前を付けて保存で別名で保存のほうが手っ取り早いと思います。
保存したものを、再度開いて表示倍率を確認してみてください。
Susumu Zenba
Microsoft MVP for Business Productivity-Word