通常は、スキャナーだったり、複合機だったりすると、基本的にスキャンするためのソフトや機能はついています。
付属していたCDなどがなくても、メーカーのHPなどからダウンロードできることも多いと思います。
なので付属のソフトだけで通常は問題なく取り込むことが可能です。付属のソフトにもよりますが、取り込んだものをJPEGの画像データとして保存したり、PDFデータとして保存したりすることもできます。
OCR系のソフトも付属しているケースもありますが、この辺りはスキャナーだったり、複合機次第といったところかと思います。
また私は使ったことはありませんが、フリーウェアとかだと以下のようなソフトもあります。