プレゼンテーションを作成し、マルチメディア オブジェクトやテキストによる特殊効果などのグラフィック効果を追加するためのツールを提供する Microsoft プレゼンテーション グラフィック製品のファミリ。
スライド1枚だけで行ってみましたが、単純なためか現象が再現せず正常に表示されました。
互換性の問題なのか、破損状態となってしまったのか原因はわかりません。
削除されたグラフのスライドは、消えてしまい残っていないと思いますが、保存ファイルには含まれている状態と思います。
メッセージが表示されグラフのあるスライドが抜けてしまう保存ファイルが残っているようでしたら、コピーファイルを作成して
・別の場所(違うフォルダーに移動、USBメモリなどのデバイス)に移動して開けるか
・ファイルを右クリックして、送る→zip形式にして、zip ファルダーに作成された pptx を開けるか
といったことを試してみてはどうでしょう。
不可の場合、グラフを挿入したスライドのみを作成して保存し、正常に開くことができるようであれば、グラフの削除されているファイルにグラフのスライドを追加挿入してみてはどうでしょう。
ファイルを追加を開いて、[ホーム]タブ→新しいスライド→スライドの再利用から、グラフだけのスライドファイルを選択して挿入して、一つのファイルにします。
再度保存する前に、[ファイル]タブ→情報→[問題のチェック]→[互換性チェック] を行ってみたほうが良さそうです。
Excel で作成したグラフについては、保存したプレゼンテーションファイルの、ファイル名の拡張子 .pptx を .zip に変更し、zip ファイルを展開して ppt → embeddings フォルダーを開くと、グラフを作成した Excel のファイルが存在していますので、このファイルをどこかのフォルダーにコピーしておけば、再利用できると思います。
拡張子を .zip に変更時に警告が表示されますが、そのまま実行して変更します。
ファイルを取り出した後は、拡張子を元の .pptx に戻してください。