コンテンツ、知識、アプリケーションの共有と管理に使用される Microsoft 製品とテクノロジのグループ。
こんにちは。
今回ご質問いただいている SharePoint とは、Office 365 サービスの一つである、クラウドサービスの SharePoint Online ということでよろしかったでしょうか。
もし、オンプレミス版の SharePoint の場合には、こちらの SharePoint フォーラム までご質問くださいますようお願いいたします。
本件では、SharePoint Online のご質問として記載いたします。
SharePoint Online では、同一階層で表示できるアイテムの数が 5000 件で制限されております。このため、この制限を超えた (5000 件以上) のアイテムがライブラリやリストに投稿され、それらのアイテムを同一階層で表示しようとすると、ご質問のメッセージが表示される動作となります。
ご質問の中で 3000 程度のファイルと記載いただいておりますが、ファイルだけでなく、フォルダを作成されている場合には、これらもアイテム数に含まれるため、ファイル・フォルダを含め 5000 以上のアイテムが投稿されている可能性が考えられます。
データが消えることはございませんが、正しく表示できない状況となりますので、5000 件以下での運用をお勧めいたします。
参考情報
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リストビューのしきい値については、以下の公開情報に詳細が記載されております。ご確認ください。
また、もし、5000 件以上のアイテムを格納して運用する必要がある場合には、以下の公開情報に記載のある対処策が有効な場合もございます。合わせてお役立てください。