Web、メール、印刷ドキュメントを作成するための Microsoft ワード プロセッシング ソフトウェア製品のファミリ。
外字エディタ― (eudcedit) で適当な外字を作成して、Microsoft IME および Office IME 2010 の IME パッドから Word 2016 に入力してみましたが、正常に表示されて現象を再現できませんでした。
Windows 7 (64bit)+Office 2016 (32bit) で最新バージョンに更新済みで、Windows クラシック表示に設定しています。
外字登録したのは Shift JIS の外字 (sjis:F040~F043、unicode:U+E000~E003) で、下図は Shift jis の外字のほうから Word に入力してみた結果です。