Office アプリの設定、プロダクト キーの引き換え、ライセンス認証を行うことに関する Microsoft 365 のプロセス。
https://technet.microsoft.com/ja-jp/library/cc982159(v=office.14).aspx
https://technet.microsoft.com/ja-jp/library/cc178956.aspx
https://technet.microsoft.com/ja-jp/library/ee624360.aspx
この辺を使えば可能だと思います。
C2R と MSI が混在しているとめんどくさそうな。