Fortolkbarhet - TABULAR SHAP explainer

  • Artikkel

I dette eksemplet bruker vi Kernel SHAP til å forklare en tabellklassifiseringsmodell bygget fra datasettet Adults Census.

Først importerer vi pakkene og definerer noen UDF-er vi trenger senere.

import pyspark
from synapse.ml.explainers import *
from pyspark.ml import Pipeline
from pyspark.ml.classification import LogisticRegression
from pyspark.ml.feature import StringIndexer, OneHotEncoder, VectorAssembler
from pyspark.sql.types import *
from pyspark.sql.functions import *
import pandas as pd
from pyspark.sql import SparkSession

# Bootstrap Spark Session
spark = SparkSession.builder.getOrCreate()

from synapse.ml.core.platform import *




vec_access = udf(lambda v, i: float(v[i]), FloatType())
vec2array = udf(lambda vec: vec.toArray().tolist(), ArrayType(FloatType()))

La oss nå lese dataene og lære opp en binær klassifiseringsmodell.

df = spark.read.parquet(
    "wasbs://publicwasb@mmlspark.blob.core.windows.net/AdultCensusIncome.parquet"
)

labelIndexer = StringIndexer(
    inputCol="income", outputCol="label", stringOrderType="alphabetAsc"
).fit(df)
print("Label index assigment: " + str(set(zip(labelIndexer.labels, [0, 1]))))

training = labelIndexer.transform(df).cache()
display(training)
categorical_features = [
    "workclass",
    "education",
    "marital-status",
    "occupation",
    "relationship",
    "race",
    "sex",
    "native-country",
]
categorical_features_idx = [col + "_idx" for col in categorical_features]
categorical_features_enc = [col + "_enc" for col in categorical_features]
numeric_features = [
    "age",
    "education-num",
    "capital-gain",
    "capital-loss",
    "hours-per-week",
]

strIndexer = StringIndexer(
    inputCols=categorical_features, outputCols=categorical_features_idx
)
onehotEnc = OneHotEncoder(
    inputCols=categorical_features_idx, outputCols=categorical_features_enc
)
vectAssem = VectorAssembler(
    inputCols=categorical_features_enc + numeric_features, outputCol="features"
)
lr = LogisticRegression(featuresCol="features", labelCol="label", weightCol="fnlwgt")
pipeline = Pipeline(stages=[strIndexer, onehotEnc, vectAssem, lr])
model = pipeline.fit(training)

Når modellen er opplært, velger vi tilfeldig noen observasjoner som skal forklares.

explain_instances = (
    model.transform(training).orderBy(rand()).limit(5).repartition(200).cache()
)
display(explain_instances)

Vi oppretter en tabularSHAP-forklaring, angir inndatakolonnene til alle funksjonene modellen tar, angir modellen og målutdatakolonnen vi prøver å forklare. I dette tilfellet prøver vi å forklare «sannsynlighet»-utdataene, som er en vektor på lengde 2, og vi ser bare på sannsynlighet i klasse 1. Angi targetClasses til [0, 1] hvis du vil forklare klasse 0 og 1 sannsynlighet samtidig. Til slutt eksempelviser vi 100 rader fra opplæringsdataene for bakgrunnsdata, som brukes til å integrere funksjoner i Kernel SHAP.

shap = TabularSHAP(
    inputCols=categorical_features + numeric_features,
    outputCol="shapValues",
    numSamples=5000,
    model=model,
    targetCol="probability",
    targetClasses=[1],
    backgroundData=broadcast(training.orderBy(rand()).limit(100).cache()),
)

shap_df = shap.transform(explain_instances)

Når vi har den resulterende datarammen, trekker vi ut klasse 1-sannsynligheten for modellutdataene, SHAP-verdiene for målklassen, de opprinnelige funksjonene og den sanne etiketten. Deretter konverterer vi den til en pandas-dataramme for visualisering. For hver observasjon er det første elementet i SHAP-verdivektoren grunnverdien (gjennomsnittsutdataene for bakgrunnsdatasettet), og hvert av følgende element er SHAP-verdiene for hver funksjon.

shaps = (
    shap_df.withColumn("probability", vec_access(col("probability"), lit(1)))
    .withColumn("shapValues", vec2array(col("shapValues").getItem(0)))
    .select(
        ["shapValues", "probability", "label"] + categorical_features + numeric_features
    )
)

shaps_local = shaps.toPandas()
shaps_local.sort_values("probability", ascending=False, inplace=True, ignore_index=True)
pd.set_option("display.max_colwidth", None)
shaps_local

Vi bruker plottende delplott for å visualisere SHAP-verdiene.

from plotly.subplots import make_subplots
import plotly.graph_objects as go
import pandas as pd

features = categorical_features + numeric_features
features_with_base = ["Base"] + features

rows = shaps_local.shape[0]

fig = make_subplots(
    rows=rows,
    cols=1,
    subplot_titles="Probability: "
    + shaps_local["probability"].apply("{:.2%}".format)
    + "; Label: "
    + shaps_local["label"].astype(str),
)

for index, row in shaps_local.iterrows():
    feature_values = [0] + [row[feature] for feature in features]
    shap_values = row["shapValues"]
    list_of_tuples = list(zip(features_with_base, feature_values, shap_values))
    shap_pdf = pd.DataFrame(list_of_tuples, columns=["name", "value", "shap"])
    fig.add_trace(
        go.Bar(
            x=shap_pdf["name"],
            y=shap_pdf["shap"],
            hovertext="value: " + shap_pdf["value"].astype(str),
        ),
        row=index + 1,
        col=1,
    )

fig.update_yaxes(range=[-1, 1], fixedrange=True, zerolinecolor="black")
fig.update_xaxes(type="category", tickangle=45, fixedrange=True)
fig.update_layout(height=400 * rows, title_text="SHAP explanations")
fig.show()

Relatert innhold