Baza danych ImmuneCODE

Uwaga

Ważna aktualizacja z maja 2025 r.: Szanowna społeczność, chcielibyśmy poinformować Cię o nadchodzącej zmianie dotyczącej otwartych zestawów danych Genomics, które są obecnie dostępne za pośrednictwem platformy Azure. Po starannym rozważeniu postanowiliśmy skupić się na nowych inicjatywach, które będą lepiej służyć naszej społeczności i dostosować się do naszych długoterminowych celów. W związku z tym dostęp do otwartych zestawów danych Usługi Genomics na platformie Azure zostanie wycofany w najbliższych miesiącach. Rozumiemy, że te zestawy danych były cenne dla badań, rozwoju i uczenia się, a my głęboko doceniamy wkład i zaangażowanie naszej społeczności w czasie. Dziękujemy za zrozumienie i wsparcie.

Baza danych ImmuneCODE™, która zawiera setki milionów sekwencji receptora T-komórki (TCR) z ponad 1400 osób narażonych na lub zakażonych wirusem SARS-CoV-2, i ponad 160.000 wysokiej pewności SARS-CoV-2-specyficzne TCRs. Baza danych jest dostępna bezpłatnie. Jego dane można analizować, aby pomóc globalnym inicjatywom mającym na celu zrozumienie odporności reakcji na wirusa SARS-CoV-2 i tworzenie nowych interwencji. Aby dowiedzieć się więcej na temat zestawu danych, zapoznaj się z skojarzona publikacją.

Najnowsze dostępne zestawy danych ImmuneCODE zawierają: Release 002.

• 1486 osób narażonych na wirus SARSCoV-2 lub zakażonych wirusem SARSCoV-2: ImmuneCODE-Perts-002.2.
• Przykładowe metadane: ImmuneCODE-Pert-Tags-002.2.tsv (572 KB) Wydanie 002.2.
• Wysoki poziom ufności SARS-CoV-2-specyficzny (ponad 160.000): ImmuneCODE-MIRA-Release 002.1.
• Przykładowe metadane: ImmuneCODE-Repertoire-Tags-002.2.xlsx (352 KB) wersja 002.2.

Uwaga

Firma Microsoft udostępnia zestawy danych Platformy Azure open na zasadzie "tak, jak to jest". Firma Microsoft nie udziela żadnych gwarancji, wyraźnych lub domniemanych, gwarancji ani warunków w odniesieniu do korzystania z zestawów danych. W zakresie dozwolonym zgodnie z prawem lokalnym firma Microsoft nie ponosi odpowiedzialności za wszelkie szkody lub straty, w tym bezpośrednie, wtórne, specjalne, pośrednie, przypadkowe lub karne wynikające z korzystania z zestawów danych.

Zestaw danych jest udostępniany zgodnie z pierwotnymi warunkami, na jakich firma Microsoft otrzymała dane źródłowe. Zestaw danych może zawierać dane pozyskane z firmy Microsoft.

Źródło danych

Ten zestaw danych jest duplikatem https://clients.adaptivebiotech.com/pub/covid-2020

Woluminy danych i częstotliwość aktualizacji

Ten zestaw danych zawiera około 228 GB danych i jest aktualizowany codziennie.

Lokalizacja usługi Storage

Ten zestaw danych jest przechowywany w regionach świadczenia usługi Azure Zachodnie stany USA 2. Przydzielanie zasobów obliczeniowych w regionie Zachodnie stany USA 2 jest zalecane w przypadku koligacji.

Dostęp do danych

Zachodnie stany USA 2: "https://dataset1000genomes.blob.core.windows.net/dataset"

Zachodnio-środkowe stany USA: "https://dataset1000genomes-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

Warunki użytkowania 

Aby dowiedzieć się więcej na temat warunków użytkowania danych, zapoznaj się z publikacją i warunkami użytkowania.

Kontakt biznesowy

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7418738/

Następne kroki

Wyświetl pozostałe zestawy danych w katalogu Open Datasets (Otwieranie zestawów danych).