Operação de importação
A operação de importação permite carregar dados FHIR® (Fast Healthcare Interoperability Resources) para o servidor FHIR com alta taxa de transferência usando a operação de $import. A importação dá suporte à carga de dados inicial e incremental no servidor FHIR.
Usando $import operação
Observação
Você deve ter a função importador de dados FHIR no servidor FHIR para usar $import.
Para usar $import, você precisa configurar o servidor FHIR usando as instruções no artigo Definir configurações de importação . Os dados FHIR a serem importados devem ser armazenados em arquivos específicos do recurso no formato FHIR NDJSON no repositório de blobs do Azure.
Para a operação de importação, verifique
- Todos os recursos em um arquivo devem ser do mesmo tipo. Você pode ter vários arquivos por tipo de recurso.
- Os dados a serem importados devem estar no mesmo locatário do serviço FHIR.
- O número máximo de arquivos a serem importados por operação é de 10.000.
Observação:
- A operação de importação não dá suporte a referências condicionais em recursos.
- Durante a operação de importação, se vários recursos compartilharem a mesma ID de recurso, apenas um desses recursos será importado aleatoriamente. Há um erro registrado para os recursos que compartilham a mesma ID de recurso.
Chamando $import
Faça uma POST chamada para <<FHIR service base URL>>/$import com o cabeçalho e o corpo da solicitação mostrados:
Cabeçalho da solicitação
Prefer:respond-async
Content-Type:application/fhir+json
Corpo
| Nome do Parâmetro | Descrição | Cartão. | Valores aceitos |
|---|---|---|---|
| inputFormat | Cadeia de caracteres que representa o nome do formato da fonte de dados. Atualmente, há suporte apenas para arquivos FHIR NDJSON. | 1..1 | application/fhir+ndjson |
| mode | Valor do modo de importação | 1..1 | Para o valor inicial do modo de uso InitialLoad de importação. Para o modo de importação incremental, use IncrementalLoad o valor do modo. Se nenhum valor de modo for fornecido, o valor do modo IncrementalLoad será considerado por padrão. |
| input | Detalhes dos arquivos de entrada. | 1..* | Uma matriz JSON com três partes descritas na tabela abaixo. |
| Nome da parte de entrada | Descrição | Cartão. | Valores aceitos |
|---|---|---|---|
| tipo | Tipo de recurso do arquivo de entrada | 1..1 | Um tipo de recurso FHIR válido que corresponde ao arquivo de entrada. |
| URL | URL de armazenamento do Azure do arquivo de entrada | 1..1 | Valor de URL do arquivo de entrada que não pode ser modificado. |
| etag | Etag do arquivo de entrada no armazenamento do Azure usado para verificar se o conteúdo do arquivo não foi alterado. | 0..1 | Valor de Etag do arquivo de entrada que não pode ser modificado. |
Corpo de exemplo para importação de carga inicial:
{
"resourceType": "Parameters",
"parameter": [
{
"name": "inputFormat",
"valueString": "application/fhir+ndjson"
},
{
"name": "mode",
"valueString": "InitialLoad"
},
{
"name": "input",
"part": [
{
"name": "type",
"valueString": "Patient"
},
{
"name": "url",
"valueUri": "https://example.blob.core.windows.net/resources/Patient.ndjson"
},
{
"name": "etag",
"valueUri": "0x8D92A7342657F4F"
}
]
},
{
"name": "input",
"part": [
{
"name": "type",
"valueString": "CarePlan"
},
{
"name": "url",
"valueUri": "https://example.blob.core.windows.net/resources/CarePlan.ndjson"
}
]
}
]
}
Verificando status de importação
Depois que $import é iniciado, um corpo de resposta vazio com um link de retorno de chamada é retornado no Content-location cabeçalho da resposta junto com 202-Accepted status código. Armazene esse link de retorno de chamada para marcar o status de importação.
Para marcar importar status, faça a chamada REST com o GET método para o link de retorno de chamada retornado na etapa anterior.
Você pode interpretar a resposta usando a tabela a seguir:
| Código de resposta | Corpo da resposta | Descrição |
|---|---|---|
| 202 Aceito | A operação ainda está em execução. | |
| 200 OK | O corpo da resposta não contém nenhuma entrada error.url | Todos os recursos foram importados com êxito. |
| 200 OK | O corpo da resposta contém uma entrada error.url | Erro ao importar alguns dos recursos. Consulte os arquivos localizados em error.url para obter os detalhes. O restante dos recursos foi importado com êxito. |
| Outro | Ocorreu um erro fatal e a operação foi interrompida. Os recursos importados com êxito não foram revertidos. |
A tabela a seguir fornece alguns dos campos importantes no corpo da resposta:
| Campo | Descrição |
|---|---|
| transactionTime | Hora de início da operação de importação em massa. |
| output.count | Contagem de recursos que foram importados com êxito |
| error.count | Contagem de recursos que não foram importados devido a algum erro |
| error.url | URL do arquivo que contém detalhes do erro. Cada error.url é exclusivo de uma URL de entrada. |
Resposta de exemplo:
{
"transactionTime": "2021-07-16T06:46:52.3873388+00:00",
"request": "https://importperf.azurewebsites.net/$Import",
"output": [
{
"type": "Patient",
"count": 10000,
"inputUrl": "https://example.blob.core.windows.net/resources/Patient.ndjson"
},
{
"type": "CarePlan",
"count": 199949,
"inputUrl": "https://example.blob.core.windows.net/resources/CarePlan.ndjson"
}
],
"error": [
{
"type": "OperationOutcome",
"count": 51,
"inputUrl": "https://example.blob.core.windows.net/resources/CarePlan.ndjson",
"url": "https://example.blob.core.windows.net/fhirlogs/CarePlan06b88c6933a34c7c83cb18b7dd6ae3d8.ndjson"
}
]
}
Solução de problemas
Permite soluções passo a passo para alguns códigos de erro que você pode encontrar durante a operação de importação.
200 OK, mas há um erro com a URL na resposta
Comportamento: A operação de importação é bem-sucedida e retorna 200 OK. No entanto, error.url estão presentes no corpo da resposta. Os arquivos presentes no error.url local contêm fragmentos JSON semelhantes ao exemplo abaixo:
{
"resourceType": "OperationOutcome",
"issue": [
{
"severity": "error",
"details": {
"text": "Given conditional reference '{0}' does'nt resolve to a resource."
},
"diagnostics": "Failed to process resource at line: {0} with stream start offset: {1}"
}
]
}
Causa: Os arquivos NDJSON contêm recursos com referências condicionais, que atualmente não têm suporte do $import.
Solução: Substitua as referências condicionais a referências normais nos arquivos NDJSON.
400 Solicitação Inválida
Comportamento: Falha na operação de importação e 400 Bad Request é retornada. O corpo da resposta tem o seguinte conteúdo:
{
"resourceType": "OperationOutcome",
"id": "13876ec9-3170-4525-87ec-9e165052d70d",
"issue": [
{
"severity": "error",
"code": "processing",
"diagnostics": "import operation failed for reason: No such host is known. (example.blob.core.windows.net:443)"
}
]
}
Solução: Verifique se o link para o armazenamento do Azure está correto. Verifique as configurações de rede e firewall para garantir que o servidor FHIR possa acessar o armazenamento. Se o serviço estiver em uma VNet, verifique se o armazenamento está na mesma VNet ou em uma VNet que tenha emparelhamento com a VNet do serviço FHIR.
403 Proibido
Comportamento: Falha na operação de importação e 403 Forbidden é retornada. O corpo da resposta tem o seguinte conteúdo:
{
"resourceType": "OperationOutcome",
"id": "bd545acc-af5d-42d5-82c3-280459125033",
"issue": [
{
"severity": "error",
"code": "processing",
"diagnostics": "import operation failed for reason: Server failed to authenticate the request. Make sure the value of Authorization header is formed correctly including the signature."
}
]
}
Causa: Usamos a identidade gerenciada para autenticação de armazenamento de origem. Esse erro pode ser causado por uma atribuição de função ausente ou incorreta.
Solução: Atribua a função colaborador de dados de blob de armazenamento ao servidor FHIR seguindo o guia do RBAC.
Erro interno de servidor 500
Comportamento: Falha na operação de importação e 500 Internal Server Error é retornada. O corpo da resposta tem o seguinte conteúdo:
{
"resourceType": "OperationOutcome",
"id": "0d0f007d-9e8e-444e-89ed-7458377d7889",
"issue": [
{
"severity": "error",
"code": "processing",
"diagnostics": "import operation failed for reason: The database '****' has reached its size quota. Partition or delete data, drop indexes, or consult the documentation for possible resolutions."
}
]
}
Causa: Você atingiu o limite de armazenamento do serviço FHIR.
Solução: Reduza o tamanho dos dados ou considere a API do Azure para FHIR, que tem um limite de armazenamento maior.
Próximas etapas
Neste artigo, você aprendeu sobre como a operação de importação permite importar dados FHIR para o servidor FHIR com alta taxa de transferência. Para obter mais informações sobre como converter dados em FHIR, exportar configurações para configurar uma conta de armazenamento e mover dados para Azure Synapse, consulte
FHIR® é uma marca registrada da HL7 e é usado com a permissão da HL7.
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