Dela via

GATK-resurspaket

  • Artikel

GATK-resurspaketet är en samling standardfiler för att arbeta med mänsklig sekvensering av data med GATK.

Kommentar

Microsoft tillhandahåller Azure Open Datasets i befintligt fall. Microsoft ger inga garantier, uttryckliga eller underförstådda garantier eller villkor för din användning av datauppsättningarna. I den utsträckning som tillåts enligt din lokala lag frånsäger sig Microsoft allt ansvar för eventuella skador eller förluster, inklusive direkt, följdriktig, särskild, indirekt, tillfällig eller straffbar, till följd av din användning av datauppsättningarna.

Datamängden tillhandahålls enligt de ursprungliga villkor som gällde när Microsoft tog emot källdatan. Datamängden kan innehålla data från Microsoft.

Data source

Den här datamängden är en spegling av datalagringen i https://gatk.broadinstitute.org/hc/articles/360035890811-Resource-bundle

Datavolymer och uppdateringsfrekvens

  1. datasetgatkbestpractices: 542 GB
  2. datasetgatklegacybundles: 61 GB
  3. datasetgatktestdata: 2 TB
  4. datasetpublicbroadref : 477 GB
  5. datasetbroadpublic : 3 TB

Datamängder uppdateras varje månad under den första veckan i varje månad.

Lagringsplats

Den här datamängden lagras i Azure-regionerna USA, västra 2 och USA, västra centrala. Vi rekommenderar att beräkningsresurser allokeras i USA, västra 2 eller USA, västra centrala av tillhörighetsskäl.

Dataåtkomst

  1. datasetgatkbestpractices

    USA, västra 2: 'https://datasetgatkbestpractices.blob.core.windows.net/dataset'

    USA, västra centrala: "https://datasetgatkbestpractices-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

    SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=6SaDfKtXAIfdpO%2BkvNA%2FsTNmNij%2Byh%2F%2F%2Bf98WAUqs7I%3D

  2. datasetgatklegacybundles

    USA, västra 2: 'https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset'

    USA, västra centrala: "https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

    SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=xBfxOPBqHKUCszzwbNCBYF0k9osTQjKnZbEjXCW7gU0%3D

  3. datasetgatktestdata

    USA, västra 2: 'https://datasetgatktestdata.blob.core.windows.net/dataset'

    USA, västra centrala: "https://datasetgatktestdata-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

    SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=fzLts1Q2vKjuvR7g50vE4HteEHBxTcJbNvf%2FZCeDMO4%3D

  4. datasetpublicbroadref

    USA, västra 2: 'https://datasetpublicbroadref.blob.core.windows.net/dataset'

    USA, västra centrala: "https://datasetpublicbroadref-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

    SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=DQxmjB4D1lAfOW9AxIWbXwZx6ksbwjlNkixw597JnvQ%3D

    USA, södra centrala: "https://datasetpublicbroadrefsc.blob.core.windows.net/dataset"

    SAS-token: ?sv=2023-01-03&st=2024-02-12T19%3A56%3A11Z&se=2029-02-13T 19%3A56%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=oGiNUGZ08PaabHVNtIiVEpJ1kcyqcL6ZadQcuN2ns%2FM%3D

  5. datasetbroadpublic

    USA, västra 2: 'https://datasetbroadpublic.blob.core.windows.net/dataset'

    USA, västra centrala: "https://datasetbroadpublic-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

    SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=u%2Bg2Ab7WKZEGiAkwlj6nKiEeZ5wdoJb10Az7uUwis%2Fg%3D

    USA, södra centrala: "https://datasetbroadpublicsc.blob.core.windows.net/dataset"

    SAS-token: ?sv=2023-01-03&st=2024-02-12T19%3A58%3A33Z&se=2029-02-13T19%33A58%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=C2lDhe1uwu%2FJnC9rbQO65G6%2BdEUQ%2Fl0VheXrlnIQVAs%3D

Användningsvillkor

Besök den officiella webbplatsen för GATK-resurspaketet.

Kontaktperson

Besök den officiella webbplatsen för GATK-resurspaketet.

Nästa steg

Visa resten av datauppsättningarna i katalogen Öppna datamängder.