ImmuneCODE-databas

Kommentar

Viktig uppdatering maj 2025: Kära community, Vi vill informera dig om en kommande ändring av genomikens öppna datauppsättningar som för närvarande är tillgängliga via Azure. Efter noggrant övervägande bestämde vi oss för att flytta fokus till nya initiativ som bättre kommer att tjäna vårt samhälle och anpassa oss till våra långsiktiga mål. Därför kommer åtkomsten till genomikens öppna datauppsättningar i Azure att bli inaktuell under de kommande månaderna. Vi förstår att dessa datauppsättningar var värdefulla för forskning, utveckling och lärande, och vi uppskattar djupt bidragen och engagemanget från vårt samhälle över tid. Tack för din förståelse och support.

ImmuneCODE-databasen™, som innehåller hundratals miljoner T-cellsreceptorsekvenser (TCR) från över 1 400 försökspersoner som exponerats för eller smittats med SARS-CoV-2-viruset, och över 160 000 SARS-CoV-2-specifika TCRs med hög konfidens. Databasen är tillgänglig utan kostnad. Dess data kan analyseras för att hjälpa globala initiativ som syftar till att förstå immunsvaret mot SARS-CoV-2-viruset och skapa nya interventioner. Mer information om datamängden finns i den associerade publikationen.

De senaste tillgängliga ImmunCODE-datauppsättningarna innehåller: Version 002.

• De 1 486 försökspersoner som exponerats för eller smittats med SARSCoV-2-viruset: ImmuneCODE-Repertoires-002.2.
• Exempelmetadata: ImmuneCODE-Repertoire-Tags-002.2.tsv (572 KB) Version 002.2.
• SARS-CoV-2-specific (över 160 000): ImmuneCODE-MIRA-Release 002.1.
• Exempelmetadata: ImmuneCODE-Repertoire-Tags-002.2.xlsx (352 KB) version 002.2.

Kommentar

Microsoft tillhandahåller Azure Open Datasets i befintligt fall. Microsoft ger inga garantier, uttryckliga eller underförstådda garantier eller villkor för din användning av datauppsättningarna. I den utsträckning som tillåts enligt din lokala lag frånsäger sig Microsoft allt ansvar för eventuella skador eller förluster, inklusive direkt, följdriktig, särskild, indirekt, tillfällig eller straffbar, till följd av din användning av datauppsättningarna.

Datamängden tillhandahålls enligt de ursprungliga villkor som gällde när Microsoft tog emot källdatan. Datamängden kan innehålla data från Microsoft.

Datakälla

Den här datamängden är en spegling av https://clients.adaptivebiotech.com/pub/covid-2020

Datavolymer och uppdateringsfrekvens

Den här datamängden innehåller cirka 228 GB data och uppdateras dagligen.

Lagringsplats

Den här datamängden lagras i Azure-regionerna USA, västra 2. Allokering av beräkningsresurser i USA, västra 2 rekommenderas för tillhörighet.

Dataåtkomst

USA, västra 2: 'https://dataset1000genomes.blob.core.windows.net/dataset'

USA, västra centrala: "https://dataset1000genomes-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

Användningsvillkor 

Mer information om användningsvillkoren för data finns i publikationen och användningsvillkoren.

Kontakt

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7418738/

Nästa steg

Visa resten av datauppsättningarna i katalogen Öppna datamängder.