Windows Update出来ないのは何の理由かわかりますでしょうか?
残念ながらわかりません。
どの様な手順で初期化をしたのか?そもそもがアプリが正常動作しないという不調な状態だった訳ですから、不調だった Windows の状態がさらに悪化したのではないかと推測します。
例えば、Cドライブなどのハードウェアに問題があった場合は、この質問の様にどんどん事態は悪化して行きます。間違いないのは「Windows は初期化で必ず不具合が治る訳ではない」ということです。メーカーサポートに相談して修理してみてはいかがでしょう。