Windows Update 以外にも、普通に再起動するだけでも、「Insert system~ key when ready」が表示される事がない? 基本的に、マザーボード(UFI BIOS 含む)と ELECOM の SSD(ESD-IB0960G)のハードウェア的な相性問題と思う。Windows は無関係。
普通にシャットダウンしただけでは、半分ハイバネーション(休止状態)。再起動だと、完全にシャットダウンされた後、起動する。そのため、ファームウェアが行う POST(Power On Self Test)の内容も異なる。通常のシャットダウンでは、ハードウェアの変更が無いことを前提に、POST が大幅に簡略されると思う。そのため、相性問題で認識されにくい SSD が認識された状態が維持されるのでは?
Windows 10 完全シャットダウンの特徴やメリット - HP
完全シャットダウンからの起動では、ファームウェア(UEFI BIOS)が、接続されているハードウェアのチェックを行い、その後、設定に従い起動デバイスから OS を起動する。「Insert system~ 」のメッセージは、その段階で起動デバイスが見つからなかった場合に出力されるメッセージ。つまり、ELECOM の SSD がファームウェアに正しく認識されていない事を表す。
対策は、ダイナブックか SSD のファームウェアのアップデートで、相性問題の解消を祈るくらいしか無いと思う。後は、別の製品に買い換えるか。ダイナブックのファームウェアの設定項目詳細を知らないので、もしかしたら、何か相性を改善する項目があるかも知れないけど・・・。
なお、ダイナブックは、リカバリーメディアの入手を、購入した PC で作成する以外の手段を提供していないし、クリーンインストール用のドライバ類の提供もしていない。ユーザーによる内蔵ストレージ交換は、間違いなく保証適用外の認定を受けると思う。もし、ダイナブックのサポートに連絡するなら、覚悟して連絡を。