Microsoft ファイルのホスティングおよび同期サービス。
> onedrive内のファイルが全てファイル名と内容がずれている
ブラウザ版OneDriveとOneDriveアプリでの差異ですか?
同期状態などを確認しましたか?
ブラウザ版OneDriveで見える内容を (正) と捉えた方が良いかと思います。
> サーバーログの調査
ブラウザ版OneDriveにて、ファイル単位であればバージョン履歴を確認してください。
幸いにもMicrosoft365のサブスクリプションを保有されている様ですね。
サブスクリプションでの大きなメリットとして、OneDrive全体の復元があります。
その画面では、ファイルの更新履歴も確認出来ます。
必要に応じてOneDrive全体を復元してみてください。
(下記は組織向けOneDrive for Businessですが、個人向けOneDriveでも同様な様です。)