Genomics データ レイク
Genomics データ レイクは、無料でアクセスでき、お使いのゲノミクス解析のワークフローやアプリケーションに統合できるさまざまな公開データセットを提供しています。 データセットには、ゲノム配列、変異情報、被験者/サンプルのメタデータが BAM、FASTA、VCF、CSV ファイル形式で含まれています。
Genomics Data Lake は米国西部 2 および米国中西部 Azure リージョンでホストされています。 アフィニティのため、米国西部 2 と米国中西部にコンピューティング リソースを割り当てることをお勧めします。
注意
データセットの使用は、データセットの所有者により設定された使用条件に基づきます。 適用される使用条件については、各データセットの詳細ページをご覧ください。
データセット
| データセット | 説明 |
|---|---|
| Illumina Platinum Genomes | Illumina Platinum Genomes |
| Human Reference Genomes | Human Reference Genomes |
| ClinVar Annotations | ClinVar Annotations |
| SnpEff | SnpEff: ゲノム バリアントのアノテーションと機能効果予測のツールボックス |
| gnomAD | gnomAD: ゲノム集計データベース |
| 1000 ゲノム | 1000 ゲノム |
| OpenCravat | OpenCravat: 変異のオープン カスタム ランク付け分析ツールキット |
| ENCODE | ENCODE: DNA 要素の百科事典 |
| GATK Resource Bundle | GATK リソース バンドル |
| TCGA Open Data | TCGA Open Data |
| Pan UK-Biobank | Pan UK-Biobank |
次のステップ
Open Datasets カタログの残りのデータセットを表示します。