GATK-resourcebundel
De GATK-resourcebundel is een verzameling standaardbestanden voor het werken met menselijke resequencing-gegevens met de GATK.
Notitie
Microsoft biedt Azure Open Datasets op basis van 'zoals is'. Microsoft geeft geen garanties, uitdrukkelijk of impliciet, garanties of voorwaarden met betrekking tot uw gebruik van de gegevenssets. Voor zover toegestaan volgens uw lokale wetgeving, wijst Microsoft alle aansprakelijkheid af voor eventuele schade of verliezen, waaronder directe, gevolgschade, speciale, indirecte, incidentele of strafbare gegevenssets, die het gevolg zijn van uw gebruik van de gegevenssets.
Deze gegevensset wordt geleverd onder de oorspronkelijke voorwaarden dat Microsoft de brongegevens heeft ontvangen. De gegevensset kan gegevens bevatten die afkomstig zijn van Microsoft.
Gegevensbron
Deze gegevensset is een weerspiegeling van het gegevensarchief op https://gatk.broadinstitute.org/hc/articles/360035890811-Resource-bundle
Gegevensvolumes en updatefrequentie
- datasetgatkbestpractices : 542 GB
- datasetgatklegacybundles: 61 GB
- datasetgatktestdata: 2 TB
- datasetpublicbroadref: 477 GB
- datasetbroadpublic : 3 TB
Gegevenssets worden maandelijks bijgewerkt in de eerste week van elke maand.
Opslaglocatie
Deze gegevensset is opgeslagen in de Azure-regio's US - west 2 en VS - west-centraal. Het wordt aanbevolen om rekenresources in US - west 2 of VS - west-centraal toe te wijzen voor affiniteit.
Data Access
datasetgatkbestpractices
VS - west 2: 'https://datasetgatkbestpractices.blob.core.windows.net/dataset'
VS - west-centraal: 'https://datasetgatkbestpractices-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=6SaDfKtXAIfdpO%2BkvNA%2FsTNmNij%2Byh%2F%2F%2Bf98WAUqs7I%3D
datasetgatklegacybundles
VS - west 2: 'https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset'
VS - west-centraal: 'https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=xBfxOPBqHKUCszzwbNCBYF0k9osTQjKnZbEjXCW7gU0%3D
datasetgatktestdata
VS - west 2: 'https://datasetgatktestdata.blob.core.windows.net/dataset'
VS - west-centraal: 'https://datasetgatktestdata-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=fzLts1Q2vKjuvR7g50vE4HteEHBxTcJbNvf%2FZCeDMO4%3D
datasetpublicbroadref
VS - west 2: 'https://datasetpublicbroadref.blob.core.windows.net/dataset'
VS - west-centraal: 'https://datasetpublicbroadref-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=DQxmjB4D1lAfOW9AxIWbXwZx6ksbwjlNkixw597JnvQ%3D
VS - zuid-centraal: 'https://datasetpublicbroadrefsc.blob.core.windows.net/dataset'
SAS-token: ?sv=2023-01-03&st=2024-02-12T19%3A56%3A11Z&se=2029-02-13T19%3A56%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=oGiNUGZ08PaabHVNtIiVEpJ1kcyqcL6ZadQcuN2ns%2FM%3D
datasetbroadpublic
VS - west 2: 'https://datasetbroadpublic.blob.core.windows.net/dataset'
VS - west-centraal: 'https://datasetbroadpublic-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS-token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=u%2Bg2Ab7WKZEGiAkwlj6nKiEeZ5wdoJb10Az7uUwis%2Fg%3D
VS - zuid-centraal: 'https://datasetbroadpublicsc.blob.core.windows.net/dataset'
SAS-token: ?sv=2023-01-03&st=2024-02-12T19%3A58%3A33Z&se=2029-02-13T19%3A58%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=C2lDhe1uwu%2FJnC9rbQO65G6%2BdEUQ%2Fl0VheXrlnIQVAs%3DD
Gebruiksrechtovereenkomst
Ga naar de officiële site van de GATK-resourcebundel.
Contactpersoon
Ga naar de officiële site van de GATK-resourcebundel.
Volgende stappen
Bekijk de rest van de gegevenssets in de catalogus Open Datasets.