OpenCravat: Aangepaste gerangschikte analyse van varianten-toolkit openen

OpenCRAVAT is een Python-pakket waarmee genomische variantinterpretatie wordt uitgevoerd, waaronder invloed op varianten, aantekeningen en scoren. OpenCRAVAT heeft een modulaire architectuur met een groot aantal analysemodules en annotatieresources die kunnen worden geselecteerd en geïnstalleerd/uitgevoerd op basis van de behoeften van een bepaald onderzoek.

Zie opencravat voor meer informatie over de gegevens.

Notitie

Microsoft biedt Azure Open Datasets op basis van 'zoals is'. Microsoft geeft geen garanties, uitdrukkelijk of impliciet, garanties of voorwaarden met betrekking tot uw gebruik van de gegevenssets. Voor zover toegestaan volgens uw lokale wetgeving, wijst Microsoft alle aansprakelijkheid af voor eventuele schade of verliezen, waaronder directe, gevolgschade, speciale, indirecte, incidentele of strafbare gegevenssets, die het gevolg zijn van uw gebruik van de gegevenssets.

Deze gegevensset wordt geleverd onder de oorspronkelijke voorwaarden dat Microsoft de brongegevens heeft ontvangen. De gegevensset kan gegevens bevatten die afkomstig zijn van Microsoft.

Gegevensbron

Deze gegevensset is een mirror van de opslagplaats op https://store.opencravat.org en https://run.opencravat.org

Gegevensvolumes en updatefrequentie

Deze gegevensset bevat 500 GB aan gegevens en wordt dagelijks bijgewerkt.

Opslaglocatie

Deze gegevensset is opgeslagen in de Azure-regio's US - west 2 en VS - west-centraal. Het wordt aanbevolen om rekenresources in US - west 2 of VS - west-centraal toe te wijzen voor affiniteit.

Data Access

VS - west 2: 'https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset'

VS - west-centraal: 'https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

SAS-token: sv=2020-04-08&st=2021-03-11T23%3A50%3A01Z&se=2025-07-26T22%3A50%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=J9J9wnJOXsmEy7TFMq9wjcxjXDE%2B7KhGpCUL4elsC14%3D

Gebruiksrechtovereenkomst

OpenCRAVAT is beschikbaar met een GPLv3-licentie. De meeste gegevensbronnen zijn gratis voor niet-commercieel gebruik. Raadpleeg voor commercieel gebruikt de institutionele contacten voor elke gegevensbron.

Contactpersoon

rkarchi1@jhmi.edu

Volgende stappen

Bekijk de rest van de gegevenssets in de catalogus Open Datasets.