Genomics Data Lake
De Genomics Data Lake biedt verschillende openbare gegevenssets die u gratis kunt openen en die u kunt integreren in uw genomics-analysewerkstromen en -toepassingen. De gegevenssets bevatten genoomsequenties, variantgegevens en onderwerp-/sample-metagegevens in BAM-, FASTA-, VCF- en CSV-bestandsindelingen.
De Genomics Data Lake wordt gehost in de Azure-regio's US - west 2 en VS - west-centraal. Het wordt aanbevolen om rekenresources in US - west 2 en VS - west-centraal toe te wijzen voor affiniteit.
Notitie
Het gebruik van gegevenssets is onderhevig aan voorwaarden die zijn ingesteld door de eigenaren van de gegevensset. Zie de detailpagina voor elke gegevensset voor de toepasselijke voorwaarden.
Gegevenssets
| Gegevenssets | Description |
|---|---|
| Illumina Platinum Genomes | Illumina Platinum Genomes |
| Menselijke referentiegenomen | Menselijke referentiegenomen |
| ClinVar Annotations | ClinVar Annotations |
| SnpEff | SnpEff: werkset voor genoomvariantannotaties en functionele effectvoorspelling |
| gnomAD | gnomAD: Genoomaggregatiedatabase |
| 1000 genomen | 1000 genomen |
| OpenCravat | OpenCravat: Open aangepaste geclassificeerde analyse van de variantentoolkit |
| CODEREN | ENCODE: Encyclopedia of DNA Elements |
| GATK-resourcebundel | GATK-resourcebundel |
| TCGA Open Data | TCGA Open Data |
| Pan UK-Biobank | Pan UK-Biobank |
Volgende stappen
Bekijk de rest van de gegevenssets in de catalogus Gegevenssets openen.